نوع مقاله : مقاله پژوهشی
نویسندگان
1 کارشناسی‌ارشد، گروه بیوتکنولوژی، واحد سبزوار، دانشگاه آزاد اسلامی، سبزوار، ایران
2 استادیار گروه زیست‌شناسی، واحد سبزوار، دانشگاه آزاد اسلامی، سبزوار، ایران
3 کارشناسی‌ارشد، مرکز تحقیقات سلولی و مولکولی، دانشگاه علوم پزشکی سبزوار، سبزوار، ایران
چکیده
زمینه و هدف: سندرم شیوگرن-لارسون (SLS) یک اختلال اتوزومال مغلوب می‌باشد که دارای سه مشخصه شامل ایکتیوز شدید، عقب‌ماندگی ذهنی، دی پلژی یا تتراپلژی اسپاستیک می‌باشد. با این وجود علایم دیگر؛ شامل اختلالات گفتاری و شناختی و همچنین صرع باعث شده است که متخصصان به‌راحتی این سندرم را شناسایی نکنند. امروزه با کمک تکنیک whole exome sequencing می‌توان درصد بالایی از این سندروم‌های هم‌پوشان را شناسایی کرد. در این مطالعه با به‌کارگیری این تکنیک سندروم SLS در یک خانواده ساکن سبزوار با سابقه ازدواج خویشاوندی شناسایی شد.
مواد و روش‌ها: با استفاده از تکنیک Whole exome sequencing کل اگزون‌ها بررسی شد و پس از فیلترینگ و آنالیز، ژن‌های کاندید انتخاب و با تکنیک PCR و توالی‌یابی سنگر در اعضای دیگر خانواده تأیید گردید.
یافته‌ها: بررسی ژنتیکی مطالعه نشان داد که جهش در ژن ALDH3A2 با واریانت پاتوژنیک c.943C>T باعث این سندروم شده است.
نتیجه‌گیری: توالی‌یابی اگزوم، کمک بسیار بزرگی به خانواده‌ها در شناسایی علت بیماری کرده است. با این وجود بسیاری از این سندروم‌ها درمان اختصاصی ندارند و تنها کمک می‌کند که خانواده‌ها از تولد فرزندان با واریانت موردنظر جلوگیری کنند.
کلیدواژه‌ها
موضوعات
عنوان مقاله [English]
Investigation of Inherited Causes of Sjogren-Larsson Syndrome Using Whole Exome Sequencing Method
نویسندگان [English]
- Atefeh Hassanzadeh 1
- aliakbar jannatabadi 2
- Abolfazl Rad 3
1 Department of Biotechnology, Sabzevar Medical Sciences Branch, , Islamic Azad University, Sabzevar,Iran
2 Assistant professor, Department of Biology, Sabzevar Branch, Islamic Azad University, Sabzevar, Iran
3 Msc, Cellular and Molecular Research Center, Sabzevar University of Medical Sciences, Sabzevar, Iran
چکیده [English]
Introduction: Sjogren-Larsson Syndrome (SLS) is a recurrent autosomal recessive disorder characterized by three main symptoms including ichthyosis, mental retardation, dysplasia, or spastic tetraplegia. However, other symptoms such as cognitive deficits, delayed speech and seizures were frequently observed. Because of these overlap symptoms, these syndromes are categorized as unknown and rare disease. High-through put technologies such as whole exome sequencing (WES) solved many of these unknown diseases. In this study, we used WES and introduced a family with SLS from Sabzevar – Khorasane Razavi- Iran.
Materials and Methods: Using WES, we sequenced all exons and then analyzed the annotation file. We segregated variant in other family members to confirm the candidate gene using PCR and Sanger sequencing.
Results: Our data showed that mutation in ALDH3A2 with c.943C>T pathogenic variant causes SLS syndrome in this family.
Conclusion: The advent of WES improve the ability of diagnosis in a huge number of syndromes with overlap symptoms. Nonetheless, most of syndromes do not have a specific treatment and recognizing the cause of syndromes help to families to screen during pregnancies.
کلیدواژه‌ها [English]
- Sjogren-Larsson Syndrome
- Whole exome sequencing
- ALDH3A2
)