نوع مقاله : مقاله پژوهشی
نویسندگان
1 گروه علوم زیستی، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز،ایران
2 گروه علوم زیستی، دانشکده علوم طبیعی، دانشگاه تبریز، تبریز،ایران،
3 گروه جراحی قفسه سینه، بیمارستان نورنجات، تبریز، ایران
چکیده
زمینه و هدف: سرطان پستان شایعترین بدخبمی در میان زنان جهان میباشد. مطالعات گروه جدیدی از RNAهای غیر کدکننده به نام RNAهای غیر کدکننده طویل را شناسایی کردهاند که نقش مهمی در ایجاد، گسترش و متاستاز سرطان ایفا میکنند. بنابراین هدف از مطالعه حاضر شناسایی و ارزیابی بیان RNAغیرکدکننده طویل جدید lncUSMycN در سرطان پستان میباشد.
مواد و روشها: در این مطالعه 40 بافت توموری کارسینومای تهاجمی مجاری پستان و 40 بافت سالم اطراف تومور جمع آوری شد و پس از استخراج RNA تام با استفاده از کیت ترایزول، سنتز cDNA صورت گرفت. با استفاده از روش qRT-PCR سطح بیان lncUSMycN در نمونهها بدست آمد. برای برررسی ارتباط بیان در بافتهای توموری نسبت به اطراف سالم آنها، از نرم افزار REST استفاده شد. توان بیومارکری آن نیز با استفاده از نرم افزار SigmaPlot و با رسم منحنی ROC ارزیابی شد. علاوه براین، ارتباط بیان lncUSMycN با ویژگیهای کلینیکوپاتولوژیکی نیز مورد بررسی قرار گرفت.
یافتهها: نتایج حاصل از نرم افزار REST افزایش معنی دار بیان lncUSMycN را در بافتهای توموری نسبت به حاشیه سالم مجاور آنها نشان داد (001/0 =p، CI 95%(. آنالیز منحنی ROC توان بیومارکری lncUSMycN را ثابت کرد (001/0 =p، 72/0= ROCAUC). نتایج بررسی بیان lncUSMycN با ویژگیهای کلینیکوپاتولوژیکی نشان داد که بین بیان این lncRNA با مراحل اولیه تومور (005/0 =p، CI 95%( و تومورهای با درجه تمایز بهتر (046/0 =p، CI 95%( ارتباط معنیداری وجود دارد.
نتیجهگیری: با توجه به افزایش بیان lncUSMycN در کارسینومای تهاجمی مجاری پستان، بیان این RNA غیرکدکننده طویل میتواند به عنوان یک بیومارکر تشخیصی بالقوه جدید در سرطان پستان مطرح شود.
کلیدواژهها
موضوعات
عنوان مقاله [English]
Detection of expression of novel long non-coding RNA lncUSMycN in breast tissues and its overexpression in women with breast invasive ductal carcinoma in East Azerbaijan province
نویسندگان [English]
- Reyhaneh Ravanbakhsh Gavgani 1
- Esmaeil Babaei 2
- Mohammad Ali Hosseinpourfeizi 1
- Vahid Montazeri 3
1 Department of Biological Sciences, School of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
2 Department of Biological Sciences, School of Natural Sciences, University of Tabriz, Tabriz, Iran
3 Department of Thoracic Surgery, Nour-nejat Hospital, Tabriz, Iran
چکیده [English]
Introduction: Breast cancer is the most common tumor malignancy among women worldwide. Studies have revealed new class of RNA molecules named Long non-coding RNAs that play important role in tumor development, progression and metastasis. Therefore, this study aimed to evaluate long non-coding RNA lncUSMycN expression in breast cancer.
Methods: In this study, 40 breast tumor with invasive ductal carcinoma and 40 normal marginal tissues were collected and after RNA extraction using TRizol kit, cDNA was synthesized. Expression level of lncUSMycN was obtained by applying qRT-PCR method. In order to evaluate association of lncUSMycN expression in tumor compared to normal tissues REST software was used. Biomarker potential of lncUSMycN was evaluated by drawing ROC curve using SigmaPlot. In addition, relationship between lncUSMycN expression and clinicopathological features was analysed.
Results: Results from REST indicated significant upregulation of lncUSMycN in tumor tissues compared to normal marginal specimens (95% CI, p =0.001). ROC curve analysis demonstrated the biomarker potential of lncUSMycN (ROCAUC =0.72, p=0.0006). Evaluation of the relationship between lncUSMycN expression and clinicopathological features revealed that there are significant association between lncUSMycN expression and early stages (95% CI, P=0.005) and well-differentiated tumors (95% CI, P=0.046).
Conclusion: Considering upregulation of lncUSMycN expression in invasive ductal carcinoma this lncRNA may be probably considered as a new potential diagnostic biomarker for breast cancer.
کلیدواژهها [English]
- breast invasive ductal carcinoma
- long non-coding RNA
- lncUSMycN
- Biomarker