نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

• هل ماه کارگر ¹
• مریم پیمانی ²

¹ کارشناسی ارشد، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران

² دانشیار، گروه زیست‌شناسی، دانشکده علوم پایه، واحد شهرکرد، دانشگاه آزاد اسلامی، شهرکرد، ایران

چکیده

زمینه و هدف: تغییرات بیان ژن SET1B می­تواند به‌صورت مستقیم بر بروز و پیشرفت سرطان تأثیرگذار باشد. ژن کدکننده lncRNA LIMT به‌صورت آنتی­سنس و در جهت مخالف SET1B رونوشت‌برداری می­شود. هدف از این پژوهش بررسی بیان lncRNA LIMT و SETD1B در بافت‌های توموری در مقایسه با بافت‌های سالم مجاور در بیماران سرطان کلورکتال و ارتباط این دو ژن با ویژگی‌های کلینیکی بافت‌های توموری می‌باشد.
مواد و روش‌ها: پس از جمع‌آوری 40 بافت توموری و نرمال مجاور، استخراج Total RNA و سنتز cDNA صورت گرفت و سپس سطح بیان ژن­های موردنظر در بافت‌های توموری و نرمال مقایسه شد. در نهایت نتایج به‌دست‌آمده به‌وسیله نرم­افزار Prism تحلیل آماری شد.
یافته‌ها: سطح بیان SETD1B  به‌طور معنی‌داری در نمونه‌های توموری به میزان 1/8 برابر افزایش نشان داد (0/01103=p) در حالی‌که سطح بیان LIMT  lncRNA در بافت توموری در مقایسه با بافت نرمال، تغییر چشم­گیری نداشت (0/5391=p). به علاوه سطح بیان SET1B  و LIMT lncRNA در دو گروه سنی بالای 60 سال و پایین‌تر از 60 سال در بافت‌های توموری تغیر معنی‌داری نداشت. همچنین تحلیل ROC نشان داد که SETD1B با مساحت زیر سطح نمودار AUC0/9336- و 0/9902-CI0/8771- می‌تواند جمعیت بیمار را از سالم جدا کند و می‌تواند به تشخیص بیماری سرطان کلورکتال کمک کند.
نتیجه‌گیری: با توجه به نتایج حاصل از این مطالعه می­توان گفت SETD1B در بافت توموری افزایش می‌یابد و می‌تواند به‌عنوان یک بیومارکر برای سرطان کلورکتال مورد استفاده قرار گیرد.

کلیدواژه‌ها

• ژن SETD1B
• LncRNA LIMT
• سرطان کلورکتال
• نمودار ROC

موضوعات

• ژنتیک و بیماری های آن

عنوان مقاله [English]

Evaluation of Changes in the Expression of SETD1B and Lncrna LIMT Genes in Colorectal Tumor Tissues Compared to Healthy Tissues

نویسندگان [English]

• Helmah Kargar ¹
• Maryam Peymani ²

¹ Msc of Molecular Genetics. Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Shahrekord Branch, Islamic Azad University, Shahrekord, Iran.

² Associate professor of Molecular Genetics, Department of Biology, Faculty of Basic Sciences, Shahrekord Branch, Islamic Azad University, Shahrekord, Iran

چکیده [English]

 Background: Changes in the SET1B gene expression, can directly affect the incidence and progression of cancer. The gene encoding lncRNA LIMT is transcribed as antisense in the opposite direction to SET1B.  The aim of this study was to investigate the expression of lncRNA LIMT and SETD1B in tumor tissues compared to adjacent normal in colorectal cancer and the relation between these two genes is related to the clinical features of tumor tissues.
Materials and methods: After collecting 40 tumor and adjacent normal tissues, Total RNA extraction and cDNA synthesis were performed. Then the expression levels of the desired genes in tumor and normal tissues was compared. Finally, the obtained results were statistically analyzed by Prism software.
Results: The expression level of SETD1B increased 1.8 fold changes in tumor samples (p = 0.01103) while the expression level of lncRNA LIMT in tumor tissue did not change significantly compared to normal tissue (p = 0.5391). In addition, the expression levels of SET1B and lncRNA LIMT in the two age groups over 60 years and under 60 years in tumor tissues did not change significantly. ROC analysis also showed that SETD1B with AUC = 0.336 and CI = 0.8771 - 0.9902 can separate the patient population from the healthy and can help diagnose colorectal cancer.
Conclusion: According to the results of this study, it can be said that SETD1B is increased in tumor tissue and can be used as a biomarker for colorectal cancer.

کلیدواژه‌ها [English]

• Colorectal cancer
• lncRNA LIMT
• ROC curve SETD1B gene