جواد ملکی؛ میترا خیرآبادی؛ صفیه صوفیان؛ ریحانه صباغزاده
دوره 21، شماره 4 ، مهر و آبان 1393، ، صفحه 637-645
چکیده
زمینه و هدف : ویروس htlv-1 جز خانواده رتروویروس‌ها می‌باشد ، این ویروس در انسان باعث ایجاد بیماری‌هایی نظیر لوسمی T-Cell بزرگسالان (ATL )، HAM/TSP و ... می‌گردد . یکی از پروتئین‌های مهم در این ویروس پروتئاز است که برای بلوغ ویروس نیز ضروری می‌باشد .مهارکننده‌هایی که تاکنون برای پروتئاز ساخته شده‌اند ،فعالیت مناسبی را از خود نشان نداده‌اند ...
بیشتر
زمینه و هدف : ویروس htlv-1 جز خانواده رتروویروس‌ها می‌باشد ، این ویروس در انسان باعث ایجاد بیماری‌هایی نظیر لوسمی T-Cell بزرگسالان (ATL )، HAM/TSP و ... می‌گردد . یکی از پروتئین‌های مهم در این ویروس پروتئاز است که برای بلوغ ویروس نیز ضروری می‌باشد .مهارکننده‌هایی که تاکنون برای پروتئاز ساخته شده‌اند ،فعالیت مناسبی را از خود نشان نداده‌اند .در این مطالعه سری جدیدی از مهار کننده‌ها ایجاد و با استفاده از ابزارهای محاسباتی نحوه اتصال آن‌ها به پروتئین پروتئاز سنجیده شد .
مواد و روش‌ها : ترکیبات بر اساس مشابهت با پپتید اصلی و بر پایه پپتیدوممتیک ایجاد گردیدند .ترکیبات بوسیله نرم‌افزار هایپرکم بوجود آمدند و عمل بهینه سازی بر روی لیگاندهای طراحی شده و لیگاندهای همراه با پروتئین که دارای ساختار کریستال بودند ،بعد از جدا کردن آن‌ها انجام گردید .ADME و ویژگی سمیت ترکیبات با استفاده از برنامه‌های تحت وب http://www.molinspiration.com و http://lazar-services.in-silico.ch تعیین و عمل داکینگ بر روی آن‌ها انجام گردید.
یافته‌ها: بررسی‌های ADME ترکیبات طراحی شده نتایج مناسبی را ارائه دادند .بررسی‌ها حاکی از سمیت نسبتا مناسبی برای لیگاندهای طراحی شده بودند.
نتیجه گیری: نتایج بدست آمده از داکینگ نیز نشانگر اختصاصی بودن لیگاندهای طراحی شده در مهر پروتئاز بودند. در نهایت این که نتایج نشان دادند مهارکننده‌های طراحی شده می‌توانند به عنوان ترکیبات مشابه ،داروی موثری برای مهار این پروتئین بوده ودر مقابله با این ویروس بکار روند .